中共巴彦淖尔市农牧业局机关党委是负责市农牧业局所属各单位党建工作的职能部门。下设党总支3个，党支部42个，共有党员892人。其中，在职党员576人，占64.5%；专业技术党员413人，占46.3%；女党员212人，占23.8%；少数民族党员94人，占10.5%。局机关党委的主要职责是：宣传、贯彻、执行党的路线、方针、政策和局党组的指示、决议，制定市农牧业局机关党建工作目标和具体实施办法，监督指导所属党组织完成好各项党建工作任务；负责抓好所属党组织的思想、组织、作风、制度建设，做好党员管理、教育和发展新党员工作；督促所属党组织贯彻中央、上级党委文件精神的情况以及开展思想政治工作和党的民主生活正常化的具体作法和经验，办理所属基层党组织请示的有关事宜，做好市农牧业局机关精神文明建设等各项工作。